le serveur renvoie le mauvais type MIME (fichier JNLP)

C'est bon j'ai pu contourner le problème, sans recours à
mimetype.assign = (
   ...,
   ".jnlp" => "application/x-java-jnlp-file",
   ...
)

Depuis que toile-libre est passée sous apache, les .htaccess sont supportés.

Il suffit de mettre un fichier .htaccess dans le repertoire contenant le fichier .jnpl (ou autre) et de spécifier le MIME TYPE dans ce fichier.

Il suffit de mettre dans le fichier:
AddType application/x-java-jnlp-file JNLP

Du coup il semblerait qu'avant apache il fallait passer par les administrateurs, et que maintenant les utilisateurs de toile.libre peuvent spécifier eux-même les mime-type.